В городе Аягоз впервые больница создана в 1928 году, тогда больница называлась «Аягозская районная больница». Сейчас называется КГП на ПХВ «Межрайонная больница Аягозского района» УЗ ВКО. 

Основной задачей Аягозской МРБ является оказание квалифицированной, медицинской помощи населению и организационно-методической помощи лечебно-профилактическим организациям района.

Возглавляет коллектив главный врач Омаров Шалкар Жунусович – врач высшей категории общественного здравоохранения/ социальной гигиены и организации здравоохранения. Имеет удостоверение №01375 от 28.02.2013 года за  заслуги  перед отечеством в области государственного строительства, развития экономики, и укрепления международного авторитета РК. 

Награжден национальным сертификатом  «Лучший руководитель года 2015» 2015 год. 

Орденом «За услуги в медицинской сфере» 15.10.2015года, №0011

В 2014 году присвоена высшая категория врача организатора здравоохранения. 

В 2017 году повысил свой уровень квалификации зарубежом,  в Великобритании      на тему: «Management of Healthcare Organization». 

В 2018 году Шалкар Жунусович закончил магистратуру  Казахского Национального Университета им. Аль-Фараби, по специальности «Менеджмент здравоохранения».

В 2018 году Указом Президента Республики Казахстан награжден медалью №11849  - «Ерен еңбегі үшін», в  2018 году награжден нагрудным знаком «Денсаулық сақтау ісінің үздігі». Является депутатом Аягозского районного маслихата.

В состав организационной структуры КГП на ПХВ «Аягозская МРБ» входят 15 ВА, 3 ФАП, 16 МП, а также Аягозская МРБ с отделениями стационара на 200 коек, включая терапевтическое отделение на 48 коек из них кардиологические  10 коек, детское отделение на 24 коек, инфекционное отделение на 20 коек, родильное отделение на 20 коек, ОПБ на 20 коек, ОПН -5 коек, кардиологические койки – 10 коек, хирургическое отделение на 37 коек, инсультный центр на 17 коек, реабилитационные койки – 9 коек. 

-    В 2018 году на базе Аягозской ЦРБ открылся инсультный центр II уровня. Он оснащен компьютерным томографом и рассчитан на 200 тысяч населения Аягозского, Урджарского, Жарминского районов.

-    В 2019 году проведен капитальный ремонт родильного отделении на сумму 111 215 810 тенге, и с 2019 года родильное отделение  перешло на  III уровень оказания перинатальной помощи. Закуплено медоборудование на сумму 430 997 000 тенге.

-    В 2020 году открылся Центр Чрескожного коронарного вмешательства (ЧКВ) II уровня на базе Аягозской МРБ. С этой целью выделено 375 млн.  тенге на приобретение аппарата ангиографа. для раннего выявления  сердечно - сосудистых заболеваний.

В Аягозской МРБ созданы все условия для лечения пациентов с кардиологической патологией!

Осуществляются комплексные операции, такие как коронаграфические исследования, установка стентов, электрокардиостимуляторов, проводятся ангиографические исследования кровеносных сосудов сердца. Весной 2021 года здесь, впервые была сделана эмболизация аневризмы головного мозга с использованием ангиографа. Теперь население Аягозского и соседних районов могут получить качественную медицинскую помощь при инсультах, инфарктах в Аягозе.

В состав Аягозской МРБ кроме отделении стационара входят также консультативно- диагностическая поликлиника, детская и женская консультация, противотуберкулезный кабинет, медицинские пункты школ района и другие вспомогательные подразделения, а также административно-хозяйственный отдел.

Консультативно-диагностическая поликлиника МРБ мощностью 435 посещении в смену представлена кабинетами специалистов ПМСП: терапевты, педиатры, а также кабинетами профильных специалистов: подростковый терапевт, нефролог, кардиолог, эндокринолог, хирург, травматолог, уролог, онколог, маммолог, акушер-гинеколог, офтальмолог, оториноларинголог, фтизиатры, невропатолог, психиатр, нарколог, дерматолог, инфекционист, а также отделением медицинской  профилактики и социально-психологической помощи и дневным стационаром при поликлинике.

К вспомогательным подразделениями больницы относятся: клинико-диагностическая лаборатория, физиотерапевтическое отделение, малая диагностика (ЭКГ, Эхо-КГ, УЗИ, эндоскопия), рентген кабинет и кабинет флюорографии, компьютерная томография. Аягозская межрайонная больница имеет платную палату для пациентов со всеми удобствами. 

Имеет передвижной медицинский комплекс на 5 рабочих мест для медицинского приема больных из сёл, оборудованный лабораторией, ЭКГ кабинетом, кабинетом гинеколога, кабинетом стоматолога, кабинетом окулиста, рентген кабинетом.

В Аягозской МРБ трудятся около 778 сотрудников, из них 114 врачей (7 врачей награждены орденами за отличную работу в сфере здравоохранения), 414 средни медицински работника, 123 младшего медицинского персонала, 127 прочего персонала.

Уровень категорированных  специалистов (% по категориям) : среди врачей – 50,8% (63), из них имеют высшую-8,1% (10), первую – 34,6 % (43), вторую – 8,1 % (10)

За последние 3-4 года в клиниках Англии, Турции, Литвы, России, Израила повысили свои знания 31 медицинских работников, среди них 23 врачей (акушер гинекологи - 6, неонатологи - 3, невропатологи - 4, кардиологи - 3, рентгенологи - 2, анестезиолог - 1, реабилитолог -1, организаторы здравоохранения - 3) и 8 средних медицинских работников.