История Городского центра репродукции человека берет свое начало в 1987 году. На тот момент Центр находился в статусе консультативной поликлиники и носил название «Медико-социальная помощь семье». Данное медицинское учреждение было создано приказом Отдела здравоохранения исполкома Алматинского городского совета народных депутатов г. Алматы. С открытием поликлиники у пациентов появилась уникальная возможность пройти исследования на наличие наследственных заболеваний в медико-генетической консультации и получить квалифицированную консультативную помощь специалистов в отделении «Брак и семья».

С 1988 года поликлиника «Медико-социальная помощь семье» принимает непосредственное участие в организации обследования детей на фенилкетонурию (ФКУ); медико-генетического консультирования семей выявленных больных; выездных семинаров для главных врачей родильных домов и детских учреждений, старших акушерок и клинических лаборантов; питания больных с ФКУ. Это позволило поликлинике добиться положительных результатов в выявляемости заболеваний и в повышении профессионального уровня старшего и среднего медперсонала.

Таким образом, было положено начало организации Городского центра по проведению мониторинга массового скрининга новорожденных на фенилкетонурию в городе Алматы на базе консультативной поликлиники «Медико-социальная помощь семье».

В 1991 году приказом Управления здравоохранения г.Алматы поликлинике «Медико-социальная помощь семье» был передан стационар бывшей Городской больницы №3 на 100 коек.

Также в поликлинике была внедрена система пренатальной диспансеризации, создана комиссия для решения вопроса о прерывании беременности или передачи для дальнейшей пренатальной диспансеризации в женские консультации в каждом конкретном случае. Это позволило своевременно оказывать помощь новорожденным с диагностированными врожденными пороками развития в пренатальном периоде.