Руководство по жидкостной биопсии при немелкоклеточном раке легких

В журнале Journal of Thoracic Oncology 06 июня 2018 г. опубликовано руководство International Association for the Study of Lung Cancer по жидкостной биопсии при немелкоклеточном раке легких.

Рекомендации:

- Плазма является предпочтительной, чем сыворотка, для извлечения бесклеточной опухолевой ДНК.

- Предлагаемое максимальное время с момента забора крови и до отделения плазмы составляет 2 часа для пробирок EDTA, и 3 дня для пробирок с консервантом. Лаборантам, проводящим забор и транспортировку с последующей пересылкой крови должны помнить о данных ограничениях во времени.

- Очень рекомендуется процедура двойного центрифугирования для отделения плазмы.

- Вне зависимости от типа пробирок, ни в коем случае их нельзя замораживать до отделения плазмы.

- Пробирки EDTA и пробирки для консервации, и то и другое подходят для извлечения бесклеточной опухолевой ДНК. Пробирки EDTA требуют обработки на месте и повышают риск деградации бесклеточной опухолевой ДНК и геномное ДНК загрязнение, если неправльно с ними обращаться. По сравнению с ними, пробирки с консервантом дают больше гибкости по времени до обработки и снижают риск деградации и загрязнения.

- Рекомендуется забор 2х пробирок для адекватного анализа. Большинство лабораторий требуют 2 стандарные пробирки по 10 мл.

- Выделение ДНК должно производиться с использованием протокола или набора для маленького фрагментированного ДНК.

- Допустимо применение валидированных методов качественной полимеразной цепной реакции (qPCR) с таргетированием на специфические мутации, такие как мутации EGFR. Данный метод имеет ограниченные способности, такие как только поиск дискретных заранее обозначенных мутаций в ограниченном количестве онкогенов, и таким образом пропуская редкие, но не менее клинически значимые мутации.

- Секвенирование следующего поколения (NGS) с мультиплексной панелью фокусируется на клинически значимых генах, которые: 1) задействуют валидированные защищенные от ошибок технологии с достаточной чувствительностью и специфичностью для применения для бесклеточной опухолевой ДНК ; 2) Комплексно оценивают варианты с одним основанием, инсерции (indels) , количество вариаций копий и отдают предпочтения хромосомным перестроениям. Однако NGS мультиплексные панели более дорогие на настоящий момент и не настолько широко распространены.

- Ожидаемое время получения результата анализа биопсии ткани составляет более 2-х недель и может считаться резонным, и необходимо рассмотреть жидкостную биопсию вне зависимости от анализа биопсии ткани.

Статья целиком