НИИ Акушерства и Гинекологии был создан в г. Ташкенте 1 октября 1974 года на базе родильного дома №2 по постановлению ЦК КП и Совета Министров СССР от 23 августа 1974 года за № 418. 

Создание института совпало с периодом формирования современного естествознания и медицинских знаний, организации народного здравоохранения, появления крупных очагов образования и культуры.  Институт стал первым в Узбекистане родовспомогательным и одновременно образовательным и научным учреждением, специально предназначенным для оказания помощи беременным женщинам и их детям и подготовки высококвалифицированных кадров в области повивального искусства.

На Институт была возложена разработка следующих основных направлений научной деятельности:

- проведение функциональных исследований по изучению вредного влияния климато- географических и производственных условий на состояние здоровья беременных женщин; изучение причин и механизмов развития различных нарушений кроветворной функции у них, акушерских кровотечений, ведущих к самопроизвольным абортам, гибели плода, новорожденных и рожениц.

- создание патогенетических средства и методов профилактики основных видов заболевания беременых женщин и их лечение.   

За время работы НИИАиГ  успешно выполнено много государственных программ направленных на укрепление здоровья женщин. 

Во исполнение Указа Президента Республики Узбекистан от 19 сентября 2007 года № УП-3929 «Об основных направлениях дальнейшего развития здравоохранения» и постановления Кабинета Министров Республики Узбекистан и № 145 от 21 мая 2009 года «О вопросах организации деятельности республиканских специализированных научно-практических медицинских центров»  НИИ Акушерства и Гинекологии переименован в  Республиканский специализированный научно-практический медицинский центр акушерства и гинекологии.

Сегодня РСНПМЦАиГ является одной из основных баз по оказанию высокотехнологичной помощи жительницам Узбекистана. В четырех регионах страны были созданы филиалы РСНПМЦАиГ -  Каршинская область, Наманганская область, Джизакская  область и в Республике Каракалпакстан которые в данное время успешно выполняют возложенные на них обязанности по оказанию высококвалифицированной медицинской в регионах.