История сети многопрофильных медицинских центров «Моя Клиника» берет свое начало в 1999 году, когда по решению акционеров Страхового Общества «Медэкспресс» началась реконструкция части здания на ул. Гороховой 14/26, где должен был расположиться многопрофильный медицинский центр.

Впервые свои двери для пациентов клиника открыла в 2003 году.

В то же время был разработан план по созданию сети клиник в Северо-Западном регионе. В рамках этого проекта были открыты еще две клиники ООО «Медэкспресс-сервис»: в Московском районе Санкт-Петербурга на ул. Варшавской, д. 59 и в г. Кингисепп по адресу Крикковское шоссе, д.9.

С 2010 года сеть медицинских центров носит название «Моя Клиника».