Областной центр по профилактике и борьбе со СПИДом состоит из следующих отделов: организационно – методический, отдел эпиднадзора за ВИЧ инфекцией, лечебно – диагностический, диагностической лаборатории.
Все отделы оснащены компьютерами, лаборатория комплектом современного лабораторного оборудования для ИФА (определяются антитела на ВИЧ инфекцию, маркеры вирусных гепатитов и СПИД индикаторные инфекции), автоматическими анализаторами для клинико – биохимических исследований, а также для проведения лабораторного мониторинга за эффективностью антиретровирусной терапии у больных ВИЧ-инфекцией (определение СД4/СД8 лимфоцитов)- проточным цитофлюорометром.
Центр сотрудничает с международными организациями: с американскими центрами по контролю за инфекционными заболеваниями (СДС), ПРООН, Глобальным Фондом, Проектом по контролю СПИД в Центральной Азии.
С 2007 года лаборатория центра является опорной базой для областей Западного региона (Мангистауская, Атырауская, Актюбинская области); проводит исследования на определение иммунного статуса (СД4/СД8), по результатам дозорного эпиднадзора (далее ДЭН) проводит верификацию 10% отрицательных образцов «сухой» капли крови.
Кроме этого специалистами центра проводятся семинар – тренинги, консультации по организации и проведению ДЭН, анализу показателей в этих же областях.