Павлодарский областной центр СПИД  является организационно-методическим центром по профилактике, диагностике и лечению ВИЧ-инфекции. В своем составе имеет 5 отделов:

1) отдел организации методических и профилактических мероприятий

2) отдел эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией

3) отдел лечебно-профилактической помощи

4) отдел информатики и компьютерного надзора за ВИЧ-инфекцией

5) диагностическая лаборатория.