При осмотре необходимо обратить внимание на основные клинические проявления FAOD:
- Сонливость, вялость;
- Эпизоды нарушения сознания;
- Судороги;    
- Мышечная гипотония;
- Мышечная слабость;
- Боли в мышцах при пальпации;
- Увеличение размеров печени;
- Нарушение сердечного ритма; 
- Признаки сердечной недостаточности.
Лабораторные диагностические исследования
- Рекомендовано исследование уровня свободного карнитина и ацилкарнитинов в крови всем пациентам с клиническими симптомами, характерными для FAOD
- Рекомендовано всем пациентам с клиническими симптомами характерными для FAOD определение содержания органических кислот в моче методом газовой хроматографии масс-спектрометрии для исключения других заболеваний из класса наследственных болезней обмена веществ и диагностики ГА2.
- Рекомендовано всем пациентам при выявлении биохимических изменений, свидетельствующих в пользу FAOD определение вариантов генов в образце биологического материала другом или неуточненном, неклассифицированные в других рубриках, методом секвенирования по Сенгеру (03.Я99.18.999.039) и/или методом таргетного высокопроизводительного секвенирования (03.Я99.18.998.041) и/или методом высокопроизводительного секвенирования (03.Я99.18.999.041) и/или методом полимеразной цепной реакции (03.Я99.18.999.048) и/или методом множественной лигазно-зависимой амплификации зондов (03.Я99.18.999.059) (выявление биаллельных патогенных вариантов в генах ACADM, ACADVL, HADH, ACADS, HADHA, HADHB, ETFA, ETFB, ETFDH, SLC52A3, SLC52A2, CPT2, CPT1A, SLC25A20, SLC22A5, SLC25A32, ACAD9, ECHS1 и др.) для подтверждения диагноза и проведения медико-генетического консультирования семьи. 
- Рекомендовано всем пациентам с клиническими и/или биохимическими признаками FAOD общий (клинический) анализ крови развернутый (гемоглобин, количество эритроцитов, цветовой показатель, количество лейкоцитов, тромбоцитов, лейкоцитарная формула и скорость оседания эритроцитов) для оценки основных параметров кроветворения и наличия воспалительных процессов.
- Рекомендовано всем пациентам с клиническими и/или биохимическими признаками FAOD проведение анализа крови биохимического общетерапевтического (содержание  глюкозы, общего белка, белковых фракций, альбумин, С-реактивного белка, исследование уровня общего билирубина в крови, Исследование уровня свободного и связанного билирубина в крови, холестерина, триглицеридов, липопротеидов низкой и высокой плотности (исследование уровня липопротеинов в крови), щелочной фосфатазы, креатинина, мочевины, мочевой кислоты, аммония,  аланинаминотрансферазы (АЛТ), аспартатаминотрансферазы (АСТ), гаммаглютамилтрансферазы (ГГТ), креатинфосфокиназы (КФК), Исследование уровня/активности изоферментов креатинкиназы в крови, лактатдегидрогеназа (ЛДГ),  кальция общего и ионизированного, натрия, калия, неорганического фосфора, железа, ферритина, магния, хлора, молочной кислоты), инсулина, показателей кислотно-основного равновесия (Исследование уровня буферных веществ в крови, Исследование уровня водородных ионов (рН) крови), исследование уровня молочной кислоты в крови (лактата) с целью оценки состояния печени, почек, баланса важнейших нутриентов при диетотерапии, кальциево-фосфорного обмена а также для оценки риска метаболической декомпенсации.
- Рекомендуется определение лабораторных показателей (исследование кислотно-основного состояния и газов крови(Исследование уровня буферных веществ в крови, Исследование уровня водородных ионов (рН) крови), исследование уровня молочной кислоты в крови (лактата), уровня глюкозы в крови, уровня калия в крови, уровня натрия в крови, уровня ионизированного кальция в крови, уровня хлоридов в крови) в период и при подозрении на метаболический криз пациентам с клиническими и/или биохимическими признаками FAOD с целью оценки состояния и своевременной коррекции терапии.
Рекомендовано всем пациентам с клиническими и/или биохимическими признаками FAOD общий (клинический) анализ мочи, определение кетоновых тел в моче для оценки состояния мочевыводящих путей и почек.
- Рекомендуется всем пациентам с патологией сердечно-сосудистой системы исследования уровня N-терминального фрагмента натрийуретического пропептида мозгового (NT-proBNP) в крови для своевременной диагностики сердечной недостаточности, дифференциальной диагностики с одышкой, вызванной респираторными нарушениями, для решения вопросов о старте/коррекции кардиотропной терапии.
В документе также содержатся рекомендации по проведению инструментальных диагностических исследований. 
Лечение
Документ содержит общие рекомендации по диетотерапии пациентов с FAOD, лечению пациентов с FAOD в период интеркуррентных инфекций и метаболической декомпенсации. Также приведены рекомендации по терапии отдельных форм FAOD. Содержатся рекомендации по рациону питания при дефиците SCAD, MCAD, LCHAD и TFP, VLCAD. Приведена информация по лечению пациентов с ГА2. Также даны рекомендации по применению отдельных лекарственных препаратов. 
Симптоматическое лечение
Не рекомендуется применять препараты вальпроевой кислоты** в случае необходимости назначения противоэпилептической терапии с целью предотвращения развития печеночной недостаточности.
Хирургическое лечение
При возникновении показаний для хирургических вмешательств рекомендуется коллегиальное принятие решения о тактике его проведения.