Целью деятельности учреждения является создание эффективной национальной системы органного донорства и развитие науки трансплантологии в Республике Казахстан.

Задачи центра:

• координация деятельности медицинских организаций в области трансплантации ткани и (или) органов (части органов) на территории Республики Казахстан
• участие в разработке нормативных правовых актов, регулирующих деятельность службы трансплантации в Республике Казахстан
• организация обучения специалистов Учреждения и медицинских работников, занимающихся вопросами координации службы трансплантации
• создание, мониторирование и ведение Единого Национального регистра доноров и реципиентов
• организация, координация и проведение научных исследований в области трансплантологии и содействие осуществлению иной научной и научно-исследовательской деятельности
• сотрудничество с международными организациями в области трансплантологии и смежных областях

Национальная координация служба трансплантации осуществляется в круглосуточном режиме работниками  и региональными представителями Учреждения. Для обеспечения координации службы трансплантации созданы представительства в областных центрах, крупных городах, городах республиканского значения Астана и Алматы.

В стране на сегодня функционирует 37 донорских стационара, в которых может осуществляться забор органов, 9 трансплантационных центр, имеющих лицензию на проведение операций по трансплантации. Создается Единый регистр учета доноров и реципиентов, регистр автоматизирует процессы формирования электронного списка доноров, пациентов, находящихся в листе ожидания, и реципиентов, а также бизнес-процессы координационной службы по трансплантации. Этот регистр упростит подбор пары «донор-реципиент», он будет происходить автоматически.